Análisis de distribuciones en imágenes de nanoscopía de fluorescencia

A cargo de:
Daniela Rodriguez. Instituto del Cálculo. FCEN. UBA-CONICET.
Pedro F. Aramendía. CIBION-CONICET y Dto Química Inorgánica. FCEN UBA.

Objetivo:
¿A qué se parece esta imagen de moléculas individuales obtenida en células neuronales del hipocampo?
¿Hay evidencia de alguna estructura que actúe de soporte para su ubicación?
¿Existe una tendencia hacia la asociación molecular, más allá de las restricciones impuestas por el soporte?

El trabajo intenta obtener información cuantitativa del entorno de ubicación de un conjunto de moléculas marcadas en forma fluorescente. A partir de un mapa 2D de distribuciones moleculares, como las obtenidas en microscopía de fluorescencia de súper resolución, se intenta caracterizar la geometría del entorno de ubicación molecular (solución, retículo, vesícula). Para ello proponemos usar la dimensionalidad de funciones de distribución o la dependencia de la distancia entre marcas con la densidad de marcación. En particular nos interesa describir modelos robustos para sistemas con baja densidad de marcación, donde la estructura subyacente no es evidente a la vista. Adicionalmente intentaremos responder si existe asociación molecular entre las marcas, sean estas del mismo o de diferente tipo. Los candidatos trabajarán en un entorno multidisciplinario donde conjugarán sistemas biológicos modelo con análisis de imágenes de nanoscopía de fluorescencia y estudios de asociación molecular. La formación de origen puede abarcar licenciatura en matemáticas, computación, biología, química, fisica.  

Buscamos candidatos con interés en presentarse a una beca de CONICET para realizar una tesis de doctorado en un entorno multidisciplinario.

Los interesados, puede escribir a:
pedro.aramendia@cibion.conicet.gov.ar
drodrig@dm.uba.ar