Fernández Do Porto, Darío

Darío Fernández Do Porto es doctor por la Universidad de Buenos Aires (UBA). Actualmente se desempeña como Investigador Independiente del CONICET en el Instituto de Cálculo de la UBA, donde lidera el grupo de bioinformática aplicada al estudio de microorganismos. Asimismo, es profesor adjunto en el Departamento de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA.

Cuenta con una sólida formación en bioinformática y una amplia trayectoria en genómica, transcriptómica, biología estructural y biología de sistemas. Su línea de investigación se centra en la identificación de blancos terapéuticos, el análisis de resistencia antimicrobiana y el estudio de enfermedades infecciosas, integrando enfoques computacionales y experimentales.

A lo largo de su carrera ha publicado más de 55 artículos en revistas científicas de alto impacto, ha presentado sus trabajos en congresos internacionales y ha participado activamente en proyectos de vinculación y transferencia tecnológica con el sector productivo.

En los últimos años, ha ampliado su actividad hacia la transferencia y aplicación estratégica de herramientas de bioinformática, ciencia de datos e inteligencia artificial, tanto para el análisis de sistemas biológicos complejos como para el estudio y diseño de pequeñas moléculas. Esta integración de modelado computacional, análisis masivo de datos y aprendizaje automático le ha permitido implementar soluciones biotecnológicas desde una perspectiva interdisciplinaria, promoviendo soluciones innovadoras con potencial impacto traslacional.

Además de su experiencia técnica, el Dr. Fernández Do Porto posee sólidas competencias en liderazgo y gestión de proyectos, habiendo dirigido equipos interdisciplinarios de investigación y coordinado el desarrollo de servicios bioinformáticos para empresas e instituciones académicas y tecnológicas.

1. “Leptin in embryos from control and diabetic rats during organogenesis: a modulator of nitric oxide production and lipid homeostasis.” White V, Gonzalez E, Pustovrh C, Capobianco E, Martinez N, Do Porto DF, Higa R, Jawerbaum A. Diabetes Metab Res Rev. 2007;23:580-588.
2. “CD137 differentially regulates innate and adaptive immunity against Mycobacterium tuberculosis” . Darío A. Fernández Do Porto, Javier O. Jurado, Virginia Pasquinelli, Ivana B. Alvarez, Romina H. Aspera, Rosa M. Musella, Verónica E. García. Immunology and Cell Biology. 2012;90(4):449-56.
3. “Achieving maximal speed of solution exchange for patch clamp experiments.” Jerónimo Auzmendi, Jerónimo; Fernández Do Porto, Darío, Luciano Moffatt. PLoS One. 2012;7(8):e42275.
4. “Bayesian Approach to Model CD137 Signaling in Human M. tuberculosis in vitro Responses”. Fernández Do Porto, Darío; Auzmendi, Jerónimo. PLoS One. 2013;8(2):e55987.
5. “Draft Genome Sequence of the Polyextremophilic Halorubrum sp. Strain AJ67, Isolated from Hyperarsenic Lakes in the Argentinian Puna.”. Burguener GF, Maldonado MJ, Revale S, Fernández Do Porto D, Rascován N, Vázquez M, Farías ME, Marti MA, Turjanski AG. Genome Announc. 2014;2(1):e01096-13.
6. “A whole genome bioinformatic approach to determine potential latent phase specific targets in Mycobacterium tuberculosis.” Defelipe LA, Do Porto DF, Pereira Ramos PI, Nicolás MF, Sosa E, Radusky L, Lanzarotti E, Turjanski AG, Marti MA. Tuberculosis (Edinb). 2016;97:181-92.
7. “Single nucleotide polymorphisms may explain the contrasting phenotypes of two variants of a multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strain” Bigi MM, Lopez, Blanco FC, Sasiain MD, De la Barrera S, Marti MA, Sosa EJ, Fernández Do Porto DA, Ritacco V, Bigi F, Soria MA. Tuberculosis (Edinb). 2017;103:28-36.
8. “Draft Genome of Lactobacillus helveticus ATCC 12046”. Palomino MM, Burguener G, Campos J, Allievi M, Fina Martin J Fernandez Do Porto D* and Ruzal S* (* equal contributors). Genome Announc. 2018;6(7):e01595-17.
9. “Target-Pathogen: A Structural bioinformatic approach to prioritize drug targets in pathogens”. Ezequiel J. Sosa, Germán Burguener, Esteban Lanzarotti, Lucas Defelipe, Leandro Radusky, Agustín M. Pardo, Marcelo Marti, Adrián G. Turjanski & Dario Fernández Do Porto. Nucleic Acids Research. 2018;46(D1):D413-D418.
10. “An integrative, multi-omics approach towards the prioritization of Klebsiella pneumoniae drug targets.” Pablo Ivan Pereira Ramos*, Darío Fernández Do Porto* (* equal contributors), Esteban Lanzarotti, Ezequiel J. Sosa, Germán Burguener, Agustín M. Pardo, Cecilia C. Klein, Marie-France Sagot, Ana Tereza R. de Vasconcelos, Ana Cristina Gales, Marcelo Marti, Adrián G. Turjanski & Marisa F. Nicolás. Scientific Reports. 2018;8(1):10755.
11. “Fluoromycobacteriophages can determine phenotypic rifampicin resistance of Mycobacterium tuberculosis in just 3-5 days from sputum sample taking.” Rondón L, Urdániz E, Latini C, Matteo M, Sosa E, Fernández Do Porto D, Turjanski A, Nemirovsky S, Hatfull GF, Poggi, Piuri M. Frontiers in Microbiology. 2018;9:1471.
12. “Exploring lectin-like activity of the S-layer protein of Lactobacillus acidophilus ATCC 4356” Fina Martin J*, Palomino MM*, Modenutti C, Fernández Do Porto D, Allievi MC, Zanini SH, Cutine A, Mariño K, Barquero A, Ruzal SM. Applied Microbiology and Biotechnology. 2019;103(12):4839-4857.
13. “Core regulon of the global anaerobic regulator Anr targets central metabolism functions in Pseudomonas species”. Paula M. Tribelli, Adela Lujan, Agustín Pardo, José G. Ibarra, Darío Fernández Do Porto, Andrea Smania, Nancy I. López. Scientific Reports. 2019;9(1):9065.
14. “MRSA dynamic circulation between the community and the hospital setting: new insights from a cohort study in Argentina.” Danilo Barcudi, Ezequiel J.Sosa, Ricardo Lamberghini, Analía Garnero, Dario Tosoroni, Laura Decca, Liliana Gonzalez. María A. Kuyuki, Teresa Lopez, Ivana Herrero, Paulo Cortes, Myrian Figueroa, Ana L. Egea, Paula Gagetti, Darío A. Fernandez Do Porto, Study Group of S. aureus in Córdoba, Argentina, Alejandra Corso, Adrián G.Turjanski, José L Bocco, Claudia Sola. Journal of Infection. 2020;80(1):24-37.
15. “Methylobacterium sp. 2A Is a Plant Growth-Promoting Rhizobacteria That Has the Potential to Improve Potato Crop Yield Under Adverse Conditions”. Cecilia E.M. Grossi, Elisa Fantino, Federico Serral, Dario A. Fernandez Do Porto, Rita M. Ulloa. Frontiers in Plant Science. 2020;11:71.
16. “Prioritization of potential drug targets against Bartonella bacilliformis by an integrative in-silico approach.” Mariella Farfán-López, Abraham Espinoza-Culupú, Ruth García-de-la-Guarda, Federico Serral, Ezequiel Sosa, María M Palomino, Darío Fernández Do Porto. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2020;115:e200184.
17. “El genoma del coronavirus”. Agustín Pardo, Claudio Shuster, Adrián Turjanski, Mercedes Palomino, Darío Fernández Do Porto. Química Viva, 2020.
18. “Strategies to display heterologous proteins on the cell surface of Lactic Acid Bacteria using as anchor the C-terminal domain of Lactobacillus acidophilus SlpA”. Tania B Gordillo, Miranda C Palumbo, Mariana Claudia Allievi, Darío A Fernández Do Porto, Sandra M Ruzal, María Mercedes Palomino. World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2020;36(11):169.
19. “Isolation and Characterization of vB_MsmS_Celfi, M. tuberculosis bacteriophage.” Payaslian, Florencia; Gradaschi, Victoria; Rondón, Liliana; Dieterle, María Eugenia; Urdániz, Estefanía; Di Paola, Matías; Peña, José; Zon, Fabio; Sosa, Ezequiel; Fernández Do Porto, Darío; Dunne, Matthew; Goeller, Pauline; Jochen; Raya, Raul; Reyes, Alejandro; Piuri, Mariana. Phage (New Rochelle). 2021;2(1):43-49.
20. “Genome Sequence and Characterization of Lactobacillus casei phage, vB_LcaM_Lbab1 isolated from raw milk”. Gradaschi, Victoria; Payaslian, Florencia; Rondón, Liliana; Dieterle, María Eugenia; Urdániz, Estefanía; Di Paola, Matías; Peña, José; Zon, Fabio; Sosa, Ezequiel; Fernández Do Porto, Darío; Dunne, Matthew; Goeller, Pauline; Jochen; Raya, Raul; Reyes, Alejandro; Piuri, Mariana. Phage (New Rochelle). 2021;2(1). doi:10.1089/phage.2020.0029.
21. “Expression of the tumor-expressed protein MageB2 enhances rRNA transcription.” Maria F Ladelfa, PhD; Leticia Y Peche, PhD; Gaston E Amato; Stefania Zampieri, PhD; Franco A Pascucci; Andres Fernandez Benevento; Dario Fernandez Do Porto; Andrea Dardis; Claudio Schneider. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research. 2021;1868(7):119015.
22. “Five-year microevolution of a multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strain within a patient with inadequate compliance to treatment”. Darío A Fernandez Do Porto, Johana Monteserin, Josefina Campos, Ezequiel J Sosa, Mario Matteo, Federico Serral, Noemí Yokobori, Andrés Fernández Benevento, Tomás Poklepovich, Agustín Pardo, Ingrid Wainmayer, Norberto Simboli, Florencia Castello, Roxana Paul, Marcelo Martí, Beatriz López, Adrián Turjanski, Viviana Ritacco. BMC Infectious Diseases. 2021;21(1):394.
23. “From genome to drugs: New approaches in antimicrobial discovery”. Federico Serral, Florencia Andrea Castello, Ezequiel Jorge Sosa, Agustín María Pardo, Miranda Clara Palumbo, Carlos Modenutti, María Mercedes Palomino, Alberto Lazarowski, Jeronimo Andres Auzmendi, Pablo Ivan Pereira Ramos, Marisa Fabiana Nicolás, Adrian Gustavo Turjanski, Marcelo Adrian Marti and Dario Fernández Do Porto. Frontiers in Pharmacology. 2021;12:647060.
24. “Identification of potential kinase inhibitors within the PI3K/AKT pathway of Leishmania species”. Rodrigo Ochoa, Amaya Ortega-Pajares, Florencia A. Castello, Federico Serral, Darío Fernández Do Porto, Janny A. Villa-Pulgarín, Ruben E. Varela-M, Carlos Muskus. Biomolecules. 2021;11(7):1037.
25. “Cost-Effective Method to Perform SARS-CoV-2 Variant Surveillance: Detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina”. Torres Carolina, Mojsiejczuk Laura, Acuña Dolores, Alexay Sofía, Amadio Ariel, Aulicino Paula, Debat Humberto, Fernández Franco, Goya Stephanie, König Guido, Nabaes Jodar Mercedes, Pianciola Luis, Bengoa Sofía, Cacciahue Marco, Camussone Cecilia, Dus Santos María José, Eberhardt María Florencia, Fernandez Ailen, Gismondi María Inés, Irazoqui Matías, Lusso Silvina, Marquez Nathalie, Muñoz Marianne, Natale Mónica, Pisano Belén, Puebla Andrea, Re Viviana, Sosa Ezequiel, Zaiat Jonathan, Zunino Sebastián, Fernández Do Porto Darío, Acevedo María Elina, Alvarez Lopez Cristina, Álvarez María Laura, Angeleri Patricia, Angelletti Andrés, Arca Manuel, Barbas Gabriela, Bertone Ana, Bonnet Agustina, Bourlot Ignacio, Castello Alejandro, Castro Gonzalo, Ceriani Carolina, Cimino Carlos, Cipelli Julián, Colmeiro María, Cordero Andrés, Cristina Carolina, Di Bella Sofia, Ercole Regina, Espasandin Yesica, Espul Carlos, Falaschi Andrea, Fernandez Moll Facundo, Gatelli Andrea, Goñi Sandra, Jofré María Estela, Jaramillo José, Labarta Natalia, Lacaze María Agustina, Larreche Rocio, Leiva Viviana, Levin Gustavo, Luczak Erica, Mandile Marcelo, Massone Carla, Mazzeo Melina, Medina Carla, Monaco Belén, Montoto Luciana, Mugna Viviana, Musto Alejandra, Ojeda Guillermo, Pintos Carolina, Pozzati Marcia, Rahhal Marilina, Rechimont Claudia, Remes Lenicov Federico, Rompato Gabriela, Seery Vanesa, Siri Leticia, Spina Julieta, Streitenberger Cintia, Suárez Ariel, Suárez Jorgelina, Sujanski Paula, Talia Juan Manuel, Theaux Clara, Thomas Guillermo, Ticeira Marina, Tittarelli Estefanía, Toro Rosana, Uez Osvaldo, Zaffanella María Belén, Ziehm Cecilia, Zubieta Martin, Mistchenko Alicia, Valinotto Laura, Viegas Mariana. Frontiers in Medicine. 2021;8:755463.
26. “Pathway Driven Target Selection in Klebsiella pneumoniae: Insights Into Carbapenem Exposure”. Federico Serral, Agustin Pardo, Ezequiel Jorge Sosa, Maria Mercedes Palomino, Marisa Fabiana Nicolás, Adrian Gustavo Turjanski, Pablo Ivan Pereira Ramos, Darío Fernández Do Porto. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2022;12:773405.
27. “Genome mining of Burkholderia ambifaria strain T16, a rhizobacterium able to produce antimicrobial compounds and degrade the mycotoxin fusaric acid”. Florencia Alvarez. Ester Simonetti, Walter O. Draghi, Matías Vinacour, Miranda C. Palumbo, Darío Fernández Do Porto, Marcela S. Montecchia, Irma N. Roberts, Jimena Ruiz. World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2022;38(7). doi:10.1007/s11274-022-03299-0.
28. “Selecting putative drought-tolerance markers in two contrasting soybeans”. Toum, Laila, Pérez-Borroto, Lucía Sandra, Peña-Malavera, Andrea Natalia, Luque, Catalina, Welin, Bjorn, Berenstein, Ariel, Fernández Do Porto, Darío, Vojnov, Adrian, Castagnaro, Atilio , Pardo, Esteban Mariano. Scientific Reports. 2022;12:10872.
29. “Integrating diverse layers of omic data to identify novel drug targets in Listeria monocytogenes” Miranda Palumbo, Ezequiel Sosa, Florencia Castello, Gustavo Schottlender, Federico Serral, Adrián Turjanski, María Mercedes Palomino, Darío Fernández Do Porto. Frontiers in Drug Discovery. 2022;2:969415.
30. “From Drugs to Targets: Reverse engineering the virtual screening process on a proteomic scale”. Gustavo Schottlender, Juan Manuel Prieto, Miranda Palumbo, Ezequiel Sosa, Florencia Castello, Federico Serral, Adrián Turjanski, Marcelo Marti, Darío Fernández Do Porto. Frontiers in Drug Discovery. 2022;2:969983.
31. “Spatial and seasonal variations in the bacterial community of an anthropogenic impacted urban stream”. Federico A. Vignale, Daissy Bernal Rey, Agustín M. Pardo, Facundo J. Almasqué, José G. Ibarra, Darío Fernández Do Porto, Adrián G. Turjanski, Nancy I. López, Renata J. Menéndez Helman, Laura J. Raiger Iustman. Microbial Ecology. 2023;85(3):862-874.
32. “Overview of the SARS-CoV-2 genotypes circulating in Latin America during 2021”. Jose Arturo Molina-Mora, Jhonnatan Reales-González, Erwin Camacho, Francisco DuarteMartínez, Pablo Tsukayama, Claudio Soto-Garita, Hebleen Brenes, Estela Cordero-Laurent, Andrea Ribeiro dos Santos, Cláudio Guedes Salgado, Caio Santos Silva, Jorge Santana de Souza, Gisele Nunes, Tatiane Negri, Amanda Vidal, Renato Oliveira, Guilherme Oliveira, José Esteban, Muñoz-Medina, Angel Gustavo Salas Lais, Guadalupe Mireles-Rivera, Ezequiel Sosa, Adrián Turjanski, María Cecilia Monzani, Mauricio G. Carobene, Federico Remes Lenicov, Gustavo Schottlender, Darío A. Fernández Do Porto, Jan Frederik Kreuze, Luisa Sacristán, Marcela Guevara-Suarez, Marco Cristancho, Rebeca Campos-Sánchez, Alfredo Herrera Estrella. Frontiers in Public Health. 2023;11:1095202.
33. “The Lambda Variant in Argentina: Analyzing the Evolution and Spread of SARS-CoV-2 Lineage C.37”. Nabaes Jodar, M. S., Goya, S., Valinotto, L. E., Eberhardt, M. F., Zaiat, J. J., Deitche, J. M., Amadio, A. F., Acevedo, R. M., Aguilar, J. J., Almeira, G., Azzolina, S., Debat, H. J., Fay, F., Fernandez, F., Gallego, F. V., Gismondi, M. I., Goñi, S. E., Konig, G. A., Lusso, S. B., Mistchenko, A. S., Montoto, L., Munne, M. S., Oisat, F., Panzera, Y., Pianciola, L. A., Pintos, C. E., Richard, G., Rousseaux, A., Suarez, A. C., Tittarelli, E., Ziehm, G. C., Torres, C., Muzzio, G. N., Giri, A. A., Vila, A. J., Proyecto PAIS (miembro del consorcio: Fernández Do Porto, D.). Viruses. 2023;15(3):642.
34. "Assessing the hidden diversity underlying consensus sequences of SARS-CoV-2 using VICOS, a novel bioinformatic pipeline for identification of mixed viral populations." Goya Stephanie, Sosa Ezequiel, Nabaes Jodar Mercedes, Torres Carolina, König Guido, Acuña, Dolores, Ceballos Santiago, Distéfano Ana J, Dopazo Hernán, Dus Santos María, Fass Mónica, Fernández Do Porto Darío, Fernández Ailen, Gallego Fernando, Gismondi María, Gramundi Ivan, Lusso Silvina, Martí Marcelo, Mazzeo Melina, Mistchenko Alicia S., Muñoz Hidalgo Marianne G, Natale Mónica, Nardi Cristina, Ousset Julia, Peralta Andrea, Puebla Andrea F, Pianciola Luis, Rivarola Máximo, Turjanski Adrian, Valinotto Laura, Vera Pablo A, Zaiat Jonathan, Zubrycki Jeremías, PAIS Consortium (http://pais.qb.fcen.uba.ar/), Aulicino Paula, Viegas Mariana. Virus Research. 2023;325:199035.
35. “Omics data integration facilitates drug target selection for new antiparasitics against trytrip infections” Martin Rivara-Espasandin, Miranda Palumbo, Ezequiel J Sosa, Santiago Radio, Adrián Turjanski, Jose Sotelo Silveira, Dario Fernández Do Porto*, Pablo Smircich*, *corresponding authors. Frontiers in Pharmacology. 2023;14:1136321.
36. “Genetic dissection of the degradation pathways for the mycotoxin fusaric acid in Burkholderia ambifaria T16" Matias Vinacour, Mauro Moiana, Ignasi Forné, Kirsten Jung, Patricia Calero, Pablo Ivan Nikel, Miranda Palumbo, Dario Fernández Do Porto, Axel Imhof, and Jimena Ruiz. Applied and Environmental Microbiology. 2023;89(12):e0063023.
37. “Persistence of SARS-CoV-2 RNA shedding and infectivity in immunized population: Prospective study along different epidemiological periods in Argentina.” Torres, C., Nabaes Jodar, M., Acuña, D., Zambrana Montaño, R. M., Culasso, A. C. A., Amadio, A. F., Aulicino, P., Ceballos, S., Cacciabue, M., Debat, H., Dus Santos, M. J., Eberhardt, M. F., Espul, C., Fay, F., Fernández, M. A., Fernández, F., Fernandez Muñoz, J. M., Ferrini, F., Gallego, F., Giri, A. A., et al., on behalf of Proyecto PAIS Working Group (miembro del consorcio: Fernández Do Porto, D.). Viruses. 2023;15(4):815.
38. “Omicron Waves in Argentina: Dynamics of SARS-CoV-2 Lineages BA.1, BA.2 and the Emerging BA.2.12.1 and BA.4/BA.5.” Torres, C., Nabaes Jodar, M., Acuña, D., Zambrana Montaño, R. M., Culasso, A. C. A., Amadio, A. F., Paula Aulicino, P., Ceballos, S., Cacciabue, M., Debat, H., Dus Santos, M. J., Eberhardt, M. F., Espul, C., Fay, F., Fernández, M. A., Fernández, F., Fernandez Muñoz, J. M., Ferrini, F., Gallego, F., Giri, A. A., Cerri, A., Bolatti, E., Gismondi, M. I., Goya, S., Gramundi, I., Irazoqui, J. M., König, G. A., Leiva, V., Lucero, H., Marquez, N., Nardi, C., Ortiz, B., Pianciola, L., Pintos, C. B., Puebla, A. F., Rastellini, C. V., Rojas, A. E., Sfalcin, J., Suárez, A., Tittarelli, E., Toro, R., Villanova, G. V., Ziehm, M. C., Zimmermann, M. C., Zunino, S., Proyecto PAIS Working Group (Miembro del consorcio: Fernández Do Porto, D.), Valinotto, L., Viegas, M. Viruses. 2023;15(2):312.
39. “Fever-like temperature impacts on Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa interaction, physiology, and virulence both in vitro and in vivo”. EC Solar Venero, MB Galeano, A Luqman, MM Ricardi, F Serral, D Fernandez Do Porto, SA Robaldi, BAZ Ashari, TH Munif, DE Egoburo, S Nemirovsky, J Escalante, B Nishimura, MS Ramirez, F Götz, PM Tribelli. BMC Biology. 2024;22. doi:10.1186/s12915-024-01830-3.
40. “Nitrosative stress under microaerobic conditions triggers inositol metabolism in Pseudomonas extremaustralis” Esmeralda C. Solar Venero, Lucia Giambartolomei, Ezequiel Sosa, Darío Fernández Do Porto, Nancy I. López, Paula M. Tribelli. PLoS One. 2024;19(5):e0301252.
41. “Bacterial Cytochrome P450s: A Bioinformatics Odyssey of Substrate Discovery” Gustavo Schottlender, Juan Manuel Prieto, Camila Clemente, Claudio David Schuster, Victoria Dumas, Darío Fernández Do Porto*, Marcelo Adrian Marti *. *corresponding authors. Frontiers in Microbiology. 2024;15:1343029.
42. “High-throughput prioritization of target proteins for development of new antileishmanial compounds”. Lucas Gentil Azevedo,Artur Queiroz, Aldina Barral, Richard Wheeler, Marisa Nicolás, Leonardo Paiva Farias, Ezequiel J Sosa, Darío Fernández Do Porto, Pablo Ivan Pereira Ramos. International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance. 2024;25:100538.
43. “PAPreC: A Pipeline for Antigenicity Prediction Comparison Methods across Bacteria.” Yasmmin Martins, Maiana Cerqueira e Costa, Miranda Palumbo, Darío Fernández Do Porto, Fábio Lima Custódio, Raphael Trevizani, Marisa Nicolás. ACS Omega. 2025;10. PMCID: PMC11840615.
44. “Genomic, socio-environmental, and sequencing capability patterns in the surveillance of SARS-CoV-2 in Latin America and the Caribbean up to 2023. “ Macarena Concha-Toloza, Luis Collado González, Alfredo Herrera Estrella, Dario Fernandez Do Porto, Rebeca Campos Sánchez, Jose Arturo Molina Mora. Scientific Reports. 2025;15. doi:10.1038/s41598-025-98829-9.
45. “Virological Characterization of a New Isolated Strain of Andes Virus Involved in the Recent Person-to-Person Transmission Outbreak Reported in Argentina” Rocío M. Coelho*, Sebastian Kehl*, Natalia Periolo, Daniel O. Alonso, Celeste Perez, Darío Fernández Do Porto, Gustavo Palacios, Alexis Edelstein, Carla M. Bellomo, Valeria P. Martinez. PLoS Neglected Tropical Diseases. 2025;19.
46. “Expanding kinetoplastid genome annotation through protein structure comparison” Juan Manuel Trinidad-Barnech; José Sotelo-Silveira; Dario Fernandez Do Porto; Pablo Smircich. PLoS Pathogens. 2025;21(4):e1013120.
47. “Genomic Characterization of XDR Mycobacterium tuberculosis Isolates in Argentina (2006-2015)”. Florencia A. Castello, Ezequiel J. Sosa, Josefina Campos, Johana Monteserin, Tomás Poklepovich, Miranda C .Palumbo, Federico Serral, Joaquín Messano, L. Gabriel García, Norberto Simboli, Adrián Turjanski, Roxana Paul, Beatriz López, Mario Matteo, María M. Palomino, Marcelo Martí, Darío Fernández Do Porto. BMC Infectious Diseases. 2025;25:1602. doi:10.1186/s12879-025-11913-3.
48. “Genome characterization of Enterococcus lactis strain isolated from bovine subclinical mastitis”. Melina Moliva; Franco Fernández; María Cerioli; Federico Serral; Darío Fernández Do Porto, Elina Reinoso. Microbial Pathogenesis. 2025;206:107846.
49. “Phage PL-1 Endolysin and Osmotic Stress as Tools to Enhance Heterologous Protein Display in Lactic Acid Bacteria Platform”. Gordillo TB, Jastrebow IG, De Rossi C, Lima C, Bockor SS, Allievi MC, Ruzal SM, Fernandez Do Porto DA, and Palomino MM. International Journal of Biological Macromolecules. 2025;320(Pt 3):145886.
50. “Genomic analysis and virulence features of environmental Vibrio cholerae non-O1/ non-O139 harboring CARB-type beta-lactamases” Guevara Núñez, Daiana; Morandini, Fabrizzio Nicolás, Suleyman, Geehan; Prentiss, Tyler; Kaur, Jagjeet; Maki, Gina; Bocco, José Luis; Fernández Do Porto, Darío; Zervos, Markus; Sola, Claudia del Valle ; Saka, Héctor Alex. Environmental Microbiology Reports. 2025;17(5):e70181.
51. “Phylogenomic insights into LA-MRSA from Argentine pig farm environments: novel OptrA variant and regional emergence of a ST9 lineage co-circulating with international CC398 lineages”. María José González, Julián Parada, Enrique Blasko, Ezequiel Jorge Sosa, Geehan Suleyman, Kaur Jagjeet, Gina Maki, Tyler Prentiss, Maite Corti Isgro, Natalia Pereyra, Rocío González, Agostina Dagatti, Paula Gagetti, Fernanda Pacharoni, Ricardo Toselli, Davor Nicolas Martinovic, Cesar Bonetto, Carolina Del Bo, Carina Porporatto, Dario Fernández Do Porto, Laura Decca, José Luis Bocco, María Valeria Amé, Alejandra Corso, Alicia Isabel Carranza, Marcus Zervos and Claudia Sola. Frontiers in Microbiology. 2025;16:1662779.
52. “Beyond Tanimoto: A Learned Bioactivity Similarity Index Enhances Ligand Discovery”. Gustavo Schottlender , Juan Manuel Prieto , Marcelo Adrian Marti y Dario Fernández Do Porto. Frontiers in Bioinformatics. 2025;5:1695353.
53. “Burkholderia vietnamiensis Genes Involved in Extracellular Medium-Chain-Length Polyhydroxyalkanoate Degradation”. Zhong Yap, Sion Yi, Ernesto Quintana, L. Gabriel García, Mohamad Safklou, Ryan Darragh, Andrew Hogan, Anna Motnenko, Warren Blunt, Richard Sparling, Dario Fernández Do Porto, David Levin, and Silvia Cardona. Applied and Environmental Microbiology. 2026;92. doi:10.1128/aem.00142-26.
54. “Linking Genomic Virulence and Antimicrobial Resistance Determinants to Host-Interaction Phenotypes in the Emerging Bovine Mastitis Pathogen Enterococcus lactis”. María Florencia Cerioli, Franco Daniel Fernandez, Melina Vanesa, Moliva, Mishael Sánchez-Pérez, Federico Serral, Darío Fernández Do Porto, Elina Beatriz Reinoso. Bacteria. 2026;5(2):26.
55. Genomic evidence of hospital-associated vancomycin-resistant Enterococcus faecium (CC17/clade A1) in a wastewater-impacted river in Argentina. Enrique Blasko; Gina Maki; María José González; Ana Cecilia Bardossy; Ezequiel Jorge Sosa; Geehan Suleyman; Susana Eugenia Ruiz; María Eugenia Taborra; Julian Parada; Alicia Isabel Carranza; Agostina Dagatti; Yamila Chagra; Ricardo Toselli; Davor Nicolas Martinovic; Córdoba Human VRE Study Group; Cesar Bonetto; Carolina Del Bo; Carina Porporatto; Darío Fernández Do Porto; Laura Decca; José Luis Bocco; Víctor Sebastián Blancato; Christian Magni; Hector Alex Saka; María Valeria Amé; Marcus Zervos; Claudia Sola. Microbial Genomics. Septiembre 2026.
56. “Iron-dependent metabolic rewiring drives tryptophan-associated melanin production in a clinical Pseudomonas aeruginosa strain”. Mateo N Diaz Appella, Adriana A Kolender, Mulugeta Nega, Stefania A Robaldi, Pablo M Cassanelli, Ningna Li, Elisa Liberini, Pablo Hoijemberg, Darío A Fernández Do Porto, Leonardo Pelliza, Martin Aran, Friedrich Götz, Nancy I López, Paula M Tribelli. mSystems. 2026:e0103526. doi: 10.1128/msystems.01035-26. PMID: 42831639.
57. “LigQ2: a modular framework for protein sequence-guided ligand prioritization and chemical retrieval”. Schottlender, Gustavo; Costa, Marcos; de Kemmeter, María; Varela Gamarnik, Sol; García, Lucas Gabriel; Carvalho de Abreu, Augusto; Álvarez, Mateo; Marti, Marcelo; Fernández Do Porto, Dario. Aceptado para publicación, 2026.

Cuenta con amplia experiencia en transferencia tecnológica, orientada a transformar avances en bioinformática, ciencia de datos e inteligencia artificial en soluciones concretas para el sector productivo. Ha participado en el desarrollo de herramientas y servicios computacionales para la priorización de blancos terapéuticos, el diseño molecular y diversas aplicaciones biotecnológicas, trabajando con equipos interdisciplinarios. Su actividad vincula la investigación académica con las necesidades de empresas e instituciones, facilitando la incorporación de enfoques computacionales en sus procesos de investigación y desarrollo.

2026. IA y bioinformática. Charla invitada en la Jornada de cierre de año de REDBIO Argentina: “Uso e impacto de la IA en la Biotecnología”. Fundación Cassará, CABA, 03/12/2026.

2026. IA y bioinformática como parte del modelo. Programa BIOTECH & NEGOCIOS. Universidad de San Andrés.

2026. Da biologia aos dados: como a inteligência artificial transforma a descoberta de fármacos. Universidad Federal do Pará. Belém, Pará Brasil.

2025. Aplicación de herramientas bioinformáticas en el diseño y desarrollo de nuevas drogas para el tratamientos de patógenos resistentes. Simposio Internacional de Innovación en biotecnología y genómica aplicada a la salud pública. Lima, Perú, 2025.

2025. Cómo la Bioinformática acelera el descubrimientos de Fármacos. IUDPT.

2025. La biotecnología en la era de las ciencias de datos y la inteligencia artificial. VI Congreso Latinoamericano de Farmacogenómica, Antigua, Guatemala. 2025.

2025. Redefiniendo el descubrimiento de antimicrobianos: del análisis ómico al diseño racional de fármacos. V Jornadas de investigación y difusión DM / IC /IMAS.

2024. Biotecnología en la era de las ciencias de datos y la inteligencia artificial. Tech Horizon Valparaíso, Chile.

2024. Diseño de drogas mediante la integración de herramientas in-silico. Universidad de San Marcos, Lima, Perú.

2024. Diseño de drogas mediante la integración de herramientas in-silico. Universidad Cayetano Heredia, Lima, Perú.

2024. Integración de análisis bioinformáticos en Drug Discovery. Winnipeg, Canadá.

2024. Diseño racional de antimicrobianos mediante herramientas bioinformáticas. Universidad de Costa Rica. San José de Costa Rica.

2024. Diseño racional de antimicrobianos mediante herramientas bioinformáticas. Universidad Nacional de Costa Rica, Heredia, Costa Rica.

2024. NGS en el diagnóstico de resistencia a antimicrobianos de cepas clínicas. Universidad Nacional de Costa Rica, Heredia, Costa Rica.

2024. Coordinación de la mesa redonda “Aplicaciones Industriales en las Ciencias de Datos: Desafíos en casos modelos. IUDPT, Buenos Aires, Argentina.

2024. “La revolución de la Inteligencia artificial en la biotecnología” IUDPT, Buenos Aires, Argentina.

2021. Jornadas Académicas de la Corporación para Investigaciones Biológica, Medellín, Colombia,

2021. Programa de Microbiología y Micología Instituto de Ciencias Biomédicas, Facultad de Medicina, Universidad Católica, Chile.

2021. Ciclo Internacional de Conferencias de Bioinformática de la Península de Yucatán, IIMAS, la Facultad de Ciencias de la UNAM sede Yucatán, CINVESTAV e Instituto Tecnológico de Conkal y Mérida, México.

2021. Ciclo de Conferencias Bioinformatica 2021, Venezuela. "Del genoma a la droga: nuevos enfoques en el descubrimiento de antimicrobianos".

2020. Simposio Internacional: “El Genoma de Sars-CoV-2, su evolución y epidemiología en América Latina”: Genómica y vigilancia de SARS-CoV-2 en Argentina.

2019. Third International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling (iCBSM) 2019 - (iCBSM2019). “Bioinformática aplicada al estudio de resistencia antimicrobiana y desarrollo de drogas”. Talca, Chile.

2019. Descubrimiento de nuevos antibióticos in silico, el nuevo paradigma de la investigación farmacológica. Congreso de Resistencia a antimicrobianos (RAM 2019). Quito, Ecuador.

2019. Utilización de técnicas de secuenciación masiva para el diagnóstico de susceptibilidad a drogas en tuberculosis. Congreso de Resistencia a antimicrobianos (RAM 2019). Quito, Ecuador.

2019. "A structural bioinformatic approach to prioritize drug targets in pathogens", European Bioinformatic Institute (EBI), Hinxton, United Kingdom.

2018. Priorización de blancos moleculares en patógenos. Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia.

2018. Conferencia sobre la herramienta Target Pathogen. Stanford Research Institute, Menlo Park, California, Estados Unidos.

2017. Conferencia sobre integración de datos multiómicos para selección de blancos moleculares en patógenos. Universidad de Puebla, México.

Dirección y co-dirección de investigadores

2023-actualidad. Codirección de la carrera de Investigadora de la Dra. Melina Moliva.

Dirección y co-dirección de tesis doctorales finalizadas

2025. Co-director de tesis doctoral Juan Trinidad, Instituto Clemente Estable, Montevideo, Uruguay. Calificación obtenida: 10 (diez).

2021-2025. Director de tesis doctoral del Lic. Gustavo Schottlender, FCEyN, UBA, calificación: distinguido.

2019-2022. Director de tesis doctoral de la Lic. Florencia Castello, FCEyN, UBA, calificación obtenida: distinguido.

2015-2022. Director de tesis doctoral del Lic. Ezequiel Sosa, FCEyN, UBA, calificación: sobresaliente.

2012-2017. Director asistente de tesis de doctorado: Dr. Germán Burguener, calificación obtenida: sobresaliente.

Dirección y co-dirección de tesis de maestría finalizadas

2020-2022. Asesor (director) de tesis de maestría de Evelyn Farfán López, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Lima, Perú, calificación obtenida: muy bueno.

Dirección y co-dirección de tesis de maestría en curso

Desde 2024. Asesor (director) de tesis de maestría en Biología Molecular de Evelyn Farfán López, Universidad Nacional de Trujillo, Facultad de Ciencias Biológicas, Trujillo, Perú.

Dirección y co-dirección de tesis de licenciatura finalizadas

2017-2018. Director de tesis de licenciatura del Lic. Agustín Pardo, calificación obtenida: 10 (diez).

2018-2019. Director de tesis de licenciatura del Lic. Federico Serral: calificación obtenida: 10 (diez).

2017-2018. Co-director de tesis de licenciatura del Lic. Andrés Fernández Benevento. calificación obtenida: 10 (diez).

2019-2021. Co-director de tesis de licenciatura de Miranda Palumbo, FCEyN, UBA. calificación obtenida: 10 (diez).

2022. Director de tesis de licenciatura de Luciana Gómez. Universidad de Morón. Calificación obtenida: 9 (nueve).

2024. Co-director de tesis de licenciatura de Gabriel García, FCEyN, UBA. Calificación obtenida: 10 (diez).

Dirección y co-dirección de tesis doctorales en curso

Director de tesis doctoral de Sol Varela Gamarnik, FCEyN, UBA desde 2026

Director de tesis doctoral Gabriel García, FCEyN, UBA desde 2025.

Co Director de tesis doctoral de Cristian Agustín Peyloubet, FCEyN, UBA, desde 2025.

Co-Director de tesis doctoral de Ana Paula Sotero Da Silva, UFRJ, RJ, Brasil, desde 2024.

Director de tesis doctoral del Lic. Federico Serral, FCEyN, UBA. desde 2019

Director de tesis doctoral de la Lic. Miranda Palumbo, FCEyN, UBA, desde 2021

Co-director de tesis doctoral Claudia Taborda Gomez, FFyB, UBA. 2021-2025.

Director de tesis Doctoral de Danielly Bittencourt Castro, UNIFESP – Escola Paulista de Medicina 2025-2028.

Dirección y co-dirección de tesis de licenciatura en curso

Desde 2025. Co-director de tesis de licenciatura en biología, de Germán Jurado, FCEyN, UBA.

Desde 2025. Director de tesis de licenciatura en biología de Joaquín Messano, FCEyN, UBA.

Desde 2025. Director de tesis de licenciatura de María de Kemmeter, FCEyN, UBA.

Desde 2026. Co-orientador del Trabajo de Conclusión de Curso (TCC) de Gabriel Souza da Silva, Universidade Federal do Pará (UFPA).

1. Combinación de estrategias computacionales y experimentales para la identificación de blancos moleculares y la exploración de compuestos con potencial actividad antimicrobiana contra Pseudomonas aeruginosa. UBACYT 2026. Monto: $ 1.500.000.
2. Translational Approach with AI for Klebsiella Drug Discovery (INOVAGRAM-092961). Global Grand Challenges – Gr-ADI (Gram-Negative Antibiotic Discovery Innovator). Fundaciones Gates, Wellcome y Novo Nordisk. Investigador principal del subaward argentino: USD 192.000. Monto total del proyecto: USD 2.247.075. 2025.
3. PICT-2019-01359. Desarrollo racional de nuevos fármacos para combatir Staphylococcus aureus combinando estrategias bioinformáticas y experimentales, por la Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. Monto: $ 1.063.125.
4. Exploración de nuevas drogas para el tratamiento de infecciones provocadas por Acinetobacter baumannii. Subsidio de Programación Científica, Universidad de Buenos Aires. Monto: $ 90.000. 2020-2021
5. Financiamiento por el programa CABANA (Capacity Building for Bioinformatics in Latin America) para el curso “Exploring Biological Networks and its Application in Health and Disease.” Salvador, Bahía, Brasil. USD 27.379,66, 2020.
6. PICT START UP: PICT-2018-04663. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. TB-MipSeq-Dx: Nuevas tecnologías de secuenciación genómica para la determinación eficiente del perfil de susceptibilidad a antibióticos en aislamientos clínicos de Mycobacterium tuberculosis. $ 1.140.000, 2020-2023
7. Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva. Subsidio para investigación asociado a la Escuela CELFI “Analísis bioinformático de resistencia y desarrollo de drogas a partir de genomas bacterianos II”. Monto: USD 40.000. 2018
8. Proyecto Sistema Nacional de Datos Genómicos DG-C9. Análisis de resistencia antimicrobiana y desarrollo de drogas a partir de genomas bacterianos. 2018. Monto: $ 138.580.
9. Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva. Subsidio para investigación asociado a la Escuela CELFI “Analísis bioinformático de resistencia y desarrollo de drogas a partir de genomas bacterianos”. Monto: USD 40.000, 2017.
10. Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva. Subsidio para investigación asociado a la Escuela CELFI “de la Clínica a la Genómica de agentes infecciosos bacterianos”. Monto: USD 40.000. 2016
11. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica. CONVOCATORIA PICT 2015. “Exploración y priorización de blancos moleculares para el diseño de nuevos fármacos contra Klebsiella pneumoniae y Mycobacterium tuberculosis” PICT-2015-1863. Monto $ 160.388